ディアルガ・パルキアエディション、ピカチュウエディション以外は、いずれもオリジナルカラー機種の上面カバーに印刷を施した仕様になっている。
・クリスタルエディション（2006年8月24日 - ）
ファイナルファンタジーIIIと同梱。本体色はクリスタルホワイトと同様。
・ディアルガ・パルキアエディション（2006年9月28日 - ）
ポケモンセンター・ポケモンだいすきクラブオリジナル。ジェットブラックとは異なる独自色で、メタリックブラックの塗装が施されている。販売終了。
・ジェットブラック特別仕様（2006年11月2日 - ）
ワールドサッカーウイニングイレブンDSと同梱。本体色はジェットブラックと同様。
・ノーブルピンクオシャレ魔女バージョン（2006年11月22日 - ）
オシャレ魔女?ラブandベリー ～DSコレクション～と同梱。本体色はノーブルピンクと同様。
・スカイパイレーツエディション（2007年4月26日 - ）
ファイナルファンタジーXII レヴァナント・ウイングと同梱。本体色はクリスタルホワイトと同様。
・クリスタルホワイト桃太郎バージョン（2007年4月26日 - ）
桃太郎電鉄DS TOKYO&JAPANと同梱。本体色はクリスタルホワイトと同様。
・ピカチュウエディション（2007年7月20日 - ）
ポケモンセンター・ポケモンだいすきクラブオリジナル。本体色は独自色の黄色。抽選販売。
・Wonderful World Edition（2007年7月27日 - ）
すばらしきこのせかいと同梱。本体色はグロスシルバーと同様。
・νガンダムバージョン（2007年8月9日 - ）
SDガンダム GGENERATION CROSS DRIVEと同梱。本体色はクリスタルホワイトと同様。
・Gemini Edition（2007年8月23日 - ）
ファイナルファンタジー・クリスタルクロニクル リング・オブ・フェイトと同梱。本体色はクリスタルホワイトと同様。
