GC用コントローラとメモリーカードをWiiに接続した状態
ゲームキューブ専用ソフトのプレイ
ニンテンドーゲームキューブ（以下GC）と互換性を持っており、GCの全てのソフトをプレイすることができます。ただし、インターネット対応ソフト『ファンタシースターオンライン エピソード1&2』『ファンタシースターオンライン エピソード1&2 Plus』『ファンタシースターオンライン エピソード3 カードレボリューション』『ホームランド』は、オフラインモードでしか遊べません。また、非公認ソフトであるGC専用プロアクションリプレイは、普通にディスクを入れても読み込まれず、使用することはできません。
GCのソフトを遊ぶ際は、別売のGC専用コントローラを用いなければならず、Wiiリモコン・ヌンチャク・クラシックコントローラなどのWii専用コントローラは使用できません。
また、GCのソフトのセーブデータは、GC専用メモリーカードのみに保存が可能で、Wii本体内蔵フラッシュメモリやSDメモリーカードは利用できません。なお、ゲームボーイプレーヤーは利用できないため、ゲームボーイ、ゲームボーイカラー、ゲームボーイアドバンスのソフトはプレイできません。
